Com as constantes guerras entre tribos, os colonos se aproveitaram para fazer o estabelecimento de alianças que favoreciam tanto aos seus interesses, como também aos dos próprios índios. Dessa forma, os portugueses conseguiam obter mão de obra e também um exército aliado poderoso.
Os índios eram dividos em dois grupos, sendo eles os "índios mansos", aqueles que eram aliados, e os "índios bravos", que eram considerados inimigos. Os índios mansos eram vassalos do Rei de Portugal e defensores das fronteiras do Brasil português. Eles também atuavam no controle dos escravos africanos.
O dia 1º de Abril é hoje celebrado como o Dia da Abolição da Escravidão dos Índios.